Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D7E4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D7E4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D7E4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D7E4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms