Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp19Q9D7A6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp19Q9D7A6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp19Q9D7A6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp19Q9D7A6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp19Q9D7A6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp19Q9D7A6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp19Q9D7A6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Srp19Q9D7A6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Srp19Q9D7A6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Srp19Q9D7A6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Srp19Q9D7A6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Srp19Q9D7A6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Srp19Q9D7A6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp19Q9D7A6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp19Q9D7A6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp19Q9D7A6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp19Q9D7A6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp19Q9D7A6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp19Q9D7A6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp19Q9D7A6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms