Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6P8

Calml3, Calmodulin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calml3Q9D6P8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calml3Q9D6P8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calml3Q9D6P8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms