Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr42e1Q9D665 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr42e1Q9D665 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr42e1Q9D665 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr42e1Q9D665 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr42e1Q9D665 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr42e1Q9D665 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr42e1Q9D665 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr42e1Q9D665 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr42e1Q9D665 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr42e1Q9D665 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr42e1Q9D665 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr42e1Q9D665 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr42e1Q9D665 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdr42e1Q9D665 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdr42e1Q9D665 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdr42e1Q9D665 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr42e1Q9D665 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sdr42e1Q9D665 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms