Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab11fip1Q9D620 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms