Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul5Q9D5V5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul5Q9D5V5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms