Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4f1Q9D5Q6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms