Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc7Q9D541 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms