Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam227bQ9D518 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms