Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrameQ9D4Z5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrameQ9D4Z5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 311.5 ms