Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms