Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4930578G10RikQ9D4Q4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930578G10RikQ9D4Q4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4930578G10RikQ9D4Q4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms