Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul2Q9D4H8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul2Q9D4H8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms