Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonrf3Q9D4H7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonrf3Q9D4H7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonrf3Q9D4H7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms