Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfap53Q9D439 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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