Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms