Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430402E10RikQ9D3N5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430402E10RikQ9D3N5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms