Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Creb3l4Q9D2A5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Creb3l4Q9D2A5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms