Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisal2bQ9D1Y9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2bQ9D1Y9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms