Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D6

Cthrc1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cthrc1Q9D1D6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cthrc1Q9D1D6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cthrc1Q9D1D6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms