Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms