Protein–RNA interactions for Protein: Q9D051

Pdhb, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdhbQ9D051 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PdhbQ9D051 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdhbQ9D051 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PdhbQ9D051 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdhbQ9D051 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PdhbQ9D051 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdhbQ9D051 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdhbQ9D051 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdhbQ9D051 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdhbQ9D051 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdhbQ9D051 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdhbQ9D051 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdhbQ9D051 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdhbQ9D051 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdhbQ9D051 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdhbQ9D051 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms