Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmss1Q9CZT6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms