Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnajc18Q9CZJ9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnajc18Q9CZJ9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnajc18Q9CZJ9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnajc18Q9CZJ9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnajc18Q9CZJ9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnajc18Q9CZJ9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnajc18Q9CZJ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnajc18Q9CZJ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc18Q9CZJ9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc18Q9CZJ9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms