Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rrs1Q9CYH6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrs1Q9CYH6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms