Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins3Q9CY94 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gins3Q9CY94 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms