Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nip7Q9CXK8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms