Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Sgo1Q9CXH7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Sgo1Q9CXH7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgo1Q9CXH7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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