Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Prdm5Q9CXE0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Prdm5Q9CXE0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Prdm5Q9CXE0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Prdm5Q9CXE0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm5Q9CXE0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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