Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbm8aQ9CWZ3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm8aQ9CWZ3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rbm8aQ9CWZ3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm8aQ9CWZ3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm8aQ9CWZ3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm8aQ9CWZ3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm8aQ9CWZ3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm8aQ9CWZ3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm8aQ9CWZ3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm8aQ9CWZ3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm8aQ9CWZ3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm8aQ9CWZ3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm8aQ9CWZ3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms