Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RpainQ9CWY9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpainQ9CWY9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms