Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BccipQ9CWI3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.1 ms