Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NubplQ9CWD8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms