Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms