Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sft2d3Q9CSV6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms