Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS74

Ecd, Protein ecdysoneless homolog, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EcdQ9CS74 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EcdQ9CS74 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EcdQ9CS74 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.7 ms