Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkiras2Q9CR56 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkiras2Q9CR56 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms