Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl28Q9CR40 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms