Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc43Q9CR29 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc43Q9CR29 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc43Q9CR29 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc43Q9CR29 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc43Q9CR29 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc43Q9CR29 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc43Q9CR29 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc43Q9CR29 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc43Q9CR29 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc43Q9CR29 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc43Q9CR29 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc43Q9CR29 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc43Q9CR29 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc43Q9CR29 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc43Q9CR29 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms