Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifitm3Q9CQW9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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