Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rer1Q9CQU3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms