Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sec61bQ9CQS8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sec61bQ9CQS8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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