Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL5

Mrpl18, 39S ribosomal protein L18, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl18Q9CQL5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl18Q9CQL5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl18Q9CQL5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl18Q9CQL5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl18Q9CQL5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl18Q9CQL5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl18Q9CQL5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl18Q9CQL5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl18Q9CQL5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl18Q9CQL5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl18Q9CQL5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl18Q9CQL5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms