Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rdm1Q9CQK3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdm1Q9CQK3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms