Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DenrQ9CQJ6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DenrQ9CQJ6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms