Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mrpl11Q9CQF0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms