Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ergic3Q9CQE7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic3Q9CQE7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms