Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQC3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQC3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQC3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQC3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQC3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQC3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQC3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQC3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQC3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9CQC3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQC3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms