Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chchd1Q9CQA6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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