Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc5Q9CQA1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc5Q9CQA1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms